Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRR35P0CG20 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR35P0CG20 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms