Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IL3P08700 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL3P08700 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL3P08700 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IL3P08700 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL3P08700 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL3P08700 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL3P08700 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL3P08700 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IL3P08700 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL3P08700 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL3P08700 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL3P08700 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms