Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCB1P08183 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ABCB1P08183 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms