Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALB1P05937 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALB1P05937 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CALB1P05937 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALB1P05937 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB1P05937 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALB1P05937 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALB1P05937 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALB1P05937 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CALB1P05937 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB1P05937 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALB1P05937 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CALB1P05937 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALB1P05937 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALB1P05937 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms