Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGGP02679 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGGP02679 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGGP02679 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGGP02679 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGGP02679 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGGP02679 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGGP02679 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGGP02679 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGGP02679 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGGP02679 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGGP02679 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGGP02679 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGGP02679 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGGP02679 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FGGP02679 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FGGP02679 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FGGP02679 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGGP02679 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGGP02679 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FGGP02679 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FGGP02679 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FGGP02679 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FGGP02679 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FGGP02679 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGGP02679 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGGP02679 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGGP02679 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FGGP02679 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGGP02679 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGGP02679 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FGGP02679 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FGGP02679 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms