Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT6AP02538 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT6AP02538 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT6AP02538 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms