Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD1O95696 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD1O95696 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD1O95696 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRD1O95696 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRD1O95696 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD1O95696 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD1O95696 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD1O95696 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD1O95696 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD1O95696 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD1O95696 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD1O95696 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD1O95696 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD1O95696 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD1O95696 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD1O95696 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD1O95696 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD1O95696 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD1O95696 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD1O95696 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD1O95696 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRD1O95696 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRD1O95696 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRD1O95696 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRD1O95696 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRD1O95696 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRD1O95696 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRD1O95696 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms