Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
POLR1AO95602 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
POLR1AO95602 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLR1AO95602 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLR1AO95602 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms