Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MATN4O95460 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MATN4O95460 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MATN4O95460 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MATN4O95460 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN4O95460 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN4O95460 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MATN4O95460 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN4O95460 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN4O95460 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MATN4O95460 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MATN4O95460 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MATN4O95460 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MATN4O95460 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MATN4O95460 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MATN4O95460 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN4O95460 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN4O95460 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN4O95460 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MATN4O95460 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms