Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX4O95219 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX4O95219 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX4O95219 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX4O95219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX4O95219 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX4O95219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX4O95219 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX4O95219 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX4O95219 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX4O95219 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX4O95219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX4O95219 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX4O95219 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX4O95219 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX4O95219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX4O95219 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX4O95219 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX4O95219 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX4O95219 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX4O95219 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms