Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCELO95171 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCELO95171 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCELO95171 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCELO95171 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCELO95171 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCELO95171 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCELO95171 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCELO95171 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCELO95171 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCELO95171 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCELO95171 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCELO95171 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCELO95171 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCELO95171 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCELO95171 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms