Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF9O75901 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RASSF9O75901 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF9O75901 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms