Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB3O75712 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB3O75712 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB3O75712 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB3O75712 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB3O75712 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB3O75712 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB3O75712 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB3O75712 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJB3O75712 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJB3O75712 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJB3O75712 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJB3O75712 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJB3O75712 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJB3O75712 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB3O75712 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB3O75712 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms