Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMPCBO75439 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMPCBO75439 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms