Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP3O75074 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRP3O75074 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP3O75074 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP3O75074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP3O75074 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP3O75074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRP3O75074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRP3O75074 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRP3O75074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRP3O75074 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRP3O75074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP3O75074 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP3O75074 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP3O75074 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP3O75074 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP3O75074 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP3O75074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP3O75074 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP3O75074 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP3O75074 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP3O75074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP3O75074 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP3O75074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRP3O75074 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms