Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBNO60934 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBNO60934 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBNO60934 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBNO60934 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBNO60934 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBNO60934 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBNO60934 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBNO60934 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBNO60934 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBNO60934 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBNO60934 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBNO60934 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBNO60934 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBNO60934 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBNO60934 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBNO60934 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBNO60934 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBNO60934 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBNO60934 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBNO60934 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBNO60934 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBNO60934 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBNO60934 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBNO60934 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBNO60934 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBNO60934 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBNO60934 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBNO60934 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBNO60934 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBNO60934 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBNO60934 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBNO60934 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBNO60934 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms