Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUPR1O60356 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NUPR1O60356 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms