Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF1CO43896 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KIF1CO43896 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KIF1CO43896 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms