Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC28A2O43868 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms