Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTAO43765 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTAO43765 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTAO43765 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTAO43765 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTAO43765 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTAO43765 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTAO43765 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTAO43765 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTAO43765 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTAO43765 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTAO43765 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTAO43765 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTAO43765 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTAO43765 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTAO43765 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTAO43765 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGTAO43765 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGTAO43765 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms