Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNGR3O43761 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYNGR3O43761 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNGR3O43761 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms