Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP1G1O43747 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP1G1O43747 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP1G1O43747 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms