Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SETD1AO15047 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SETD1AO15047 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SETD1AO15047 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SETD1AO15047 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SETD1AO15047 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SETD1AO15047 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms