Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF646O15015 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF646O15015 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF646O15015 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms