Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPEO14579 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPEO14579 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPEO14579 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPEO14579 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPEO14579 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPEO14579 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPEO14579 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPEO14579 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPEO14579 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPEO14579 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPEO14579 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPEO14579 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPEO14579 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPEO14579 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPEO14579 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPEO14579 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPEO14579 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPEO14579 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPEO14579 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPEO14579 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPEO14579 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPEO14579 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPEO14579 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPEO14579 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms