Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SLC25A17-204ENST00000420970 1060 ntTSL 58.7□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-205ENST00000426396 641 ntTSL 58.63□□□□□ -1.031e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-209ENST00000434193 598 ntTSL 48.16□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-207ENST00000430221 734 ntTSL 47.67□□□□□ -1.181e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.241e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 RTCB-205ENST00000487704 767 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 SLC25A17-212ENST00000447566 1243 ntTSL 56.7□□□□□ -1.341e-9■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-208ENST00000618008 647 ntTSL 36.16□□□□□ -1.421e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.442e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 COG2-208ENST00000494371 7836 ntTSL 25.92□□□□□ -1.462e-18■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 ZNF714-209ENST00000618422 649 ntTSL 35.1□□□□□ -1.591e-20■■■■■ 47.8
DDX3XO00571 BRI3-204ENST00000474291 472 ntTSL 219.08■□□□□ 0.648e-15■■■■■ 47.7
DDX3XO00571 BRI3-203ENST00000473967 819 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-14■■■■■ 47.7
DDX3XO00571 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.447e-44■■■■■ 47.7
DDX3XO00571 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.197e-44■■■■■ 47.7
DDX3XO00571 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-44■■■■■ 47.7
DDX3XO00571 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-323■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-323■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-202ENST00000553454 1492 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.417e-10■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.127e-10■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-205ENST00000556379 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.437e-10■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DHRS4-AS1-206ENST00000558423 584 ntTSL 412.1□□□□□ -0.477e-10■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DRAM1-206ENST00000551403 920 ntTSL 520.6■□□□□ 0.892e-11■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-11■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.178e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-205ENST00000485923 1078 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.478e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.988e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-206ENST00000492132 819 ntTSL 57.88□□□□□ -1.158e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.478e-9■■■■■ 47.6
DDX3XO00571 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.393e-20■■■■■ 47.5
DDX3XO00571 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 516.24■□□□□ 0.193e-20■■■■■ 47.5
DDX3XO00571 NQO2-206ENST00000380472 689 ntTSL 511.93□□□□□ -0.53e-20■■■■■ 47.5
DDX3XO00571 NQO2-208ENST00000426637 626 ntTSL 59.38□□□□□ -0.913e-20■■■■■ 47.5
DDX3XO00571 C12orf57-201ENST00000229281 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.657e-22■■■■■ 47.5
DDX3XO00571 TMEM50B-204ENST00000442441 982 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.813e-19■■■■■ 47.4
DDX3XO00571 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-19■■■■■ 47.4
DDX3XO00571 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 47.4
DDX3XO00571 TMEM50B-205ENST00000459909 618 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-19■■■■■ 47.4
DDX3XO00571 TMEM50B-201ENST00000420455 3062 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.13e-19■■■■■ 47.4
DDX3XO00571 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.264e-13■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 CAPN2-203ENST00000434648 577 ntTSL 512.1□□□□□ -0.474e-13■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.634e-13■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.774e-20■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 AIF1-204ENST00000466820 1180 ntTSL 514.11□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 AIF1-205ENST00000497362 810 ntTSL 212.4□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 AIF1-201ENST00000337917 607 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.026e-7■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 AIF1-203ENST00000376059 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.434e-20■■■■■ 47.3
DDX3XO00571 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TMEM9-205ENST00000414605 545 ntTSL 211.3□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.831e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.291e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.891e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-208ENST00000560514 638 ntTSL 217.32■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-204ENST00000558394 550 ntTSL 417.32■□□□□ 0.361e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.059e-11■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.159e-11■■■■■ 47.1
DDX3XO00571 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.236e-26■■■■■ 47
DDX3XO00571 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.156e-26■■■■■ 47
DDX3XO00571 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-26■■■■■ 47
DDX3XO00571 WDR1-213ENST00000509600 559 ntTSL 219.96■□□□□ 0.797e-11■■■■■ 47
DDX3XO00571 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-11■■■■■ 47
DDX3XO00571 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.177e-11■■■■■ 47
DDX3XO00571 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.397e-11■■■■■ 47
DDX3XO00571 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-21■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.28e-8■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 222.58■■□□□ 1.215e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.945e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.065e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.55e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.95e-11■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.517e-15■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.647e-22■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.647e-22■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.147e-22■■■■■ 46.8
DDX3XO00571 POLRMT-208ENST00000592863 966 ntTSL 519.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.498e-16■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 PNPLA3-202ENST00000406117 1480 ntTSL 215.71■□□□□ 0.18e-16■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 SAMM50-204ENST00000493161 829 ntTSL 313.55□□□□□ -0.248e-16■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 RPL12-204ENST00000497825 864 ntTSL 217.79■□□□□ 0.443e-47■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 RPL12-203ENST00000497322 2275 ntTSL 217.64■□□□□ 0.413e-47■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 RPL12-205ENST00000536368 499 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.613e-47■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 RPL12-201ENST00000361436 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.123e-47■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-9■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 46.7
DDX3XO00571 TMEM33-206ENST00000510383 697 ntTSL 39.17□□□□□ -0.949e-18■■■■■ 46.7
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