Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE2AO00408 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms