Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
I3L3M4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
I3L3M4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
I3L3M4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
I3L3M4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
I3L3M4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
I3L3M4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
I3L3M4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
I3L3M4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
I3L3M4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms