Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
B4DXG7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DXG7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DXG7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DXG7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DXG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DXG7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DXG7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DXG7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DXG7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DXG7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DXG7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DXG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DXG7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DXG7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DXG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4DXG7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DXG7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DXG7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1050.5 ms