Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS3P2A8K0S8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEIS3P2A8K0S8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MEIS3P2A8K0S8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms