Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM247A6NEH6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM247A6NEH6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM247A6NEH6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms