Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POTEFA5A3E0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POTEFA5A3E0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms