Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAMEF22A3QJZ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms