Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBA6A0AVT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA6A0AVT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA6A0AVT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms