Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F8A0AVK6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F8A0AVK6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F8A0AVK6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms