Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RABGEF1Q9UJ41 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RABGEF1Q9UJ41 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms