Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLCO1B3Q9NPD5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms