Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP4-3Q9BYR4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms