Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms