Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2Q1Q7Z7E8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms