Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 24.37□□□□□ -1.714e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 SUPT5H-208ENST00000595368 659 ntTSL 214.82□□□□□ -0.043e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 SUPT5H-220ENST00000601978 538 ntTSL 212.24□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 219.58■□□□□ 0.722e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 417.46■□□□□ 0.392e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 213.88□□□□□ -0.192e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 413.88□□□□□ -0.192e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 412.35□□□□□ -0.432e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 411.87□□□□□ -0.512e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 411.77□□□□□ -0.532e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 411.52□□□□□ -0.572e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 47.94□□□□□ -1.142e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 KANSL1-215ENST00000576870 2848 ntTSL 212.13□□□□□ -0.478e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 KANSL1-204ENST00000572218 9095 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.038e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 CLK2-205ENST00000476983 1885 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.687e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-10■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.164e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 520.15■□□□□ 0.829e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.339e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.029e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 312.24□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DHCR7-211ENST00000534701 456 ntTSL 310.96□□□□□ -0.659e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 310.53□□□□□ -0.729e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 LTBP3-215ENST00000529764 528 ntTSL 56.19□□□□□ -1.423e-8■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-323■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 210.82□□□□□ -0.681e-323■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.081e-323■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 TRIM41-208ENST00000515499 914 ntTSL 319.93■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 526.47■■□□□ 1.833e-6■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.583e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 ESPN-214ENST00000633239 1494 ntTSL 517.89■□□□□ 0.453e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.738e-23■■■□□ 15.5
PCBP2Q15366 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.781e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.426e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.726e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.776e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 TRIB1-202ENST00000519576 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.489e-8■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 UBR5-206ENST00000519528 325 ntTSL 310.1□□□□□ -0.799e-8■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RBBP6-201ENST00000319715 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.818e-10■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.027e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-212ENST00000485903 1674 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.077e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.137e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RBBP6-207ENST00000564314 3361 ntTSL 27.97□□□□□ -1.138e-10■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.447e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 PTPRK-222ENST00000532751 563 ntTSL 420.82■□□□□ 0.927e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.477e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 PTPRK-208ENST00000392449 1456 ntTSL 215.3■□□□□ 0.047e-7■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 331.08■■■□□ 2.571e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt29.39■■■□□ 2.31e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 228■■■□□ 2.073e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.761e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 MZT2A-204ENST00000445782 980 ntTSL 224.93■■□□□ 1.584e-12■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.571e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 DMTF1-230ENST00000580710 635 ntTSL 523.63■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 223.4■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 523.26■■□□□ 1.311e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 H3F3B-202ENST00000586270 468 ntTSL 223.16■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 HAGH-211ENST00000569339 820 ntTSL 322.9■■□□□ 1.261e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 STX10-208ENST00000591197 907 ntTSL 322.37■■□□□ 1.171e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.134e-12■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-211ENST00000619337 545 ntTSL 422.09■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-9■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-206ENST00000612880 593 ntTSL 219.68■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-204ENST00000522282 445 ntTSL 319.68■□□□□ 0.741e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 SAE1-211ENST00000600753 483 ntTSL 419.33■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 STX10-206ENST00000588848 1164 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-207ENST00000613853 563 ntTSL 418.54■□□□□ 0.561e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 STX10-203ENST00000440593 940 ntTSL 518.28■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 218.24■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 ADGRG1-231ENST00000564783 548 ntTSL 217.5■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 517.06■□□□□ 0.324e-12■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 ADGRG1-260ENST00000568487 536 ntTSL 217.03■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 SAE1-208ENST00000597808 570 ntTSL 216.91■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 H3F3B-207ENST00000589417 575 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 H3F3B-209ENST00000589949 842 ntTSL 216.62■□□□□ 0.251e-6■■■□□ 15.4
PCBP2Q15366 STX10-210ENST00000591843 1073 ntTSL 516.58■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 137.8 ms