Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDE4DQ08499 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDE4DQ08499 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms