Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TGM3Q08188 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TGM3Q08188 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms