Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TUBB4BP68371 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms