Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ACTBP60709 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ACTBP60709 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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