Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA5P28066 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA5P28066 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms