Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRCP23327 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRCP23327 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRCP23327 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRCP23327 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms