Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms