Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRAP18433 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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