Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RLBP1P12271 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RLBP1P12271 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms